Tipos de Alineación de Secuencia

Un alineamiento de secuencias es un método en el que se utiliza la bioinformática para analizar hebras de proteína ( tal como ADN o ARN ) y para determinar similitudes entre los filamentos examinados . La secuencia de elementos en cada sujeto normalmente se alinean en una matriz con el fin de ver mejor donde hay coincidencias . Los tipos más comunes de alineación de secuencias son pairwise alineación , alineación de secuencias múltiples y estructural alignment.Pairwise alineación

Un alineamiento por pares se realiza con dos secuencias . Una secuencia está escrito sobre el otro y luego se tomó nota de las cadenas de elementos superpuestos . Existen cadenas repetidas de elementos en una secuencia porque eran una adaptación evolutiva favorable. No todas las cadenas tienen la misma longitud y por lo tanto las lagunas y las inserciones se deben observar en el alineamiento por pares .
Alineación de secuencias múltiples

Una secuencia múltiples alineación es similar a la de pares alineación , pero utiliza más de dos secuencias de proteínas . Un alineamiento de secuencias múltiples ocasiones se puede presentar en forma de árbol - forma.
Estructural alineación

Una alineación estructural es un tipo de alineación de secuencias que compara el forma de dos o más secuencias de proteínas . A diferencia de pairwise alineación y la alineación de secuencias múltiples (ambos de los cuales sólo se refieren a los elementos dentro de las secuencias ), una alineación estructural analiza la totalidad de las secuencias como una unidad individual. Alineaciones estructurales no se escriben , sino que deben ser comparados en tres dimensiones .